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Título : Uso de la metabolómica para verificar autenticidad, origen y aporte nutracéutico entre cultivares de Tropaeolum tuberosum
Autor : Lalaleo Córdova, Liliana Paulina
Hernández Salazar, María José
Palabras clave : METABOLÓMICA
METABOLITOS
BIOTECNOLOGÍA
NUTRACÉUTICOS
CULTIVOS BIOFORTIFICADOS
TUBÉRCULOS ANDINOS
MASHUA
Fecha de publicación : mar-2022
Editorial : Universidad Técnica de Ambato. Facultad de Ciencia e Ingeniería en Alimentos y Biotecnología. Carrera de Ingeniería Bioquímica
Resumen : The present study consisted of the processing and analysis of data from a metabolomics study using the nuclear magnetic resonance technique of six different cultivars of Tropaeolum tuberosum (mashua), whose results are published by Valle-Parra et al 2020: From morphological traits to the food fingerprint of Tropaeolum tuberosum through metabolomics by NMR. Data includes: cultivar ID (A-F); sample collection area (I, II and III); information on the content of 34 metabolites (in mM); and integration values of each resonance spectrum at an interval of 0.4 ppm (234 values per spectrum). These data were subjected to multivariable analysis by PCA revealing a grouping between cultivars A-B, C-D-E and F. These three subgroups coincided with the grouping of the analysis of the collection area. Subsequently, the performance of the machine learning classification models was evaluated: LDA, SVM and RF. The former had the lowest performance with a percentage accuracy range between 83.2 and 87.6, the second between 86.5 and 96.4, and RF had the best performance between 96.4 and 100. Finally, the nutraceutical contribution of the cultivars was evaluated, and they were ranked according to their content of amino acids, carbohydrates, organic acids, among other nutrients. In global and amino acid terms, cultivar F stood out for its superior contribution to the other cultivars; cultivar A has the highest content of organic acids, while cultivars B and D of carbohydrates.
Descripción : El presente estudio consistió en el procesamiento y análisis de datos provenientes de un estudio de metabolómica por la técnica de resonancia magnética nuclear de seis distintos cultivares de Tropaeolum tuberosum (mashua), cuyos resultados están publicados por Valle-Parra et al 2020: From morphological traits to the food finger print of Tropaeolum tuberosumthrough metabolomics by NMR.Los datos incluyen: ID del cultivar (A-F); zona de recolección de muestras (I, II y III); información del contenido de 34 metabolitos (en mM); y valores de integración de cada espectro de resonancia a un intervalo de 0.4 ppm (234 valores por espectro). Estos datos fueron sometidos a análisis multivariable por PCA revelando una agrupación entre los cultivares A-B, C-D-E y F. Estos tres subgrupos coincidieron con la agrupación del análisis de la zona de recolección. Posteriormente se evaluó el desempeño de los modelos de clasificación de aprendizaje automático: LDA, SVM y RF. El primero obtuvo el desempeño más bajo con un rango de precisión en porcentajes de entre 83.2 y 87.6, el segundo entre 86.5 y 96.4 y RF tuvo el mejor desempeño entre 96.4 y 100. Finalmente, se evaluó el aporte nutraceútico de los cultivares y se jerarquizaron de acuerdo con su contenido de aminoácidos, carbohidratos, ácidos orgánicos entre otros nutrientes. En términos globales y de aminoácidos el cultivar F destacó por su aporte superior a los demás cultivares; el cultivar A tiene el más alto contenido de ácidos orgánicos, mientras que el cultivar B y D de carbohidratos.
URI : https://repositorio.uta.edu.ec/jspui/handle/123456789/34970
Aparece en las colecciones: Carrera Ingeniería Bioquímica

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