Fase analítica en el diagnóstico de infecciones del tracto urinario en el laboratorio de microbiología del hospital general IESS Ibarra
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Date
2024-09-01
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Publisher
Universidad Técnica de Ambato/Facultad de Ciencias de la Salud/Centro de posgrados
Abstract
Las infecciones del tracto urinario son consideradas a nivel mundial como la tercera
causa más común de infecciones después del tracto respiratorio, por lo cual es de suma
importancia utilizar las herramientas diagnosticas como el Elemental y microscópico
de orina (EMO) y el urocultivo debiendo existir correlación entre ellos y así obtener
un diagnóstico acertado y oportuno para una terapia antimicrobiana apropiada,
optimizando tiempo y recurso humano en el laboratorio y hospital. Evaluar el
cumplimiento de la fase analítica en el diagnóstico de Infecciones del Tracto Urinario
en el Laboratorio de microbiología del Hospital general IESS Ibarra. Se realizó un
estudio del tipo transversal, descriptivo, observacional y prospectivo con un enfoque
mixto, aplicando una lista de chequeo para valorar el cumplimiento de la fase analítica.
El proceso y posterior análisis del examen químico en el equipo (Urit-1600) y examen
microscópico equipo (Urit-1280), para el procesamiento del urocultivo, se realizó la
siembra mediante asa calibrada de 0.00, la identificación y prueba de sensibilidad en
el equipo PHOENIX M50. Se analizaron un total de 204 muestras de orina, de las
cuales se analizó la lista de chequeo de los procedimientos internos establecidos en la
institución tanto del EMO y urocultivo del análisis de cada muestra, obteniendo como
resultado que no existe relación estadísticamente significativa entre las variables
medidas y el resultado de urocultivo, con respecto al aislamiento de patógenos que se
encontraron en el estudio y fueron identificados se obtuvo en gran porcentaje
Escherichia coli como el primer germen causante de ITU con un 57%, mientras que
en segundo lugar con 12% se encuentran las muestras con poli microbiota que se les
interpreta como contaminación de la muestra de orina, mientras que en cuarto y quinto
lugar encontramos a bacterias de suma importancia hospitalaria como lo son:
Klebsiella pneumoniae y Enterobacter cloacae obteniendo un porcentaje de 7%, y no
menos importantes otros patógenos Enterobacteriales con un 17%. Para la correlación
del EMO y el urocultivo se realizó una prueba de correlación Pearson demostrando
que las bacterias poseen una fuerte relación con el urocultivo, mientras que para la
prueba de Regresión logística binomial se obtuvo un valor de 86.3% de acierto en
predicción de resultados negativos y resultados positivos frente al urocultivo, a
diferencia de una correlación moderada entre piocitos y urocultivo, el valor predictivo
fue de 77.5% siendo buen predictor de resultados negativos pero menos preciso con
los resultados positivos de urocultivo, tomando en cuenta que la predicción de los
xi
piocitos mejoraría asociándose conjuntamente con bacterias. En tanto que para las
células escamosas se obtuvo una correlación nula frente al urocultivo demostrando la
existencia de contaminación en la toma de muestra. Con estos resultados se podrá
considerar criterios de exclusión para la siembra del urocultivo sugiriendo modificar e
implementar los procedimientos internos de urocultivos. La evaluación de la fase
analítica determino que no existe relación de las variables que no cumplieron con el
procedimiento de análisis del EMO y del urocultivo, mostrando que no influyen en el
resultado final del examen tanto de EMO y urocultivo. Se identificaron diferentes
agentes patógenos, siendo el más prevalente E. coli, Se determino la correlación entre
el EMO y el urocultivo demostrando que la bacteriuria y la piuria en el EMO ayuda al
pronóstico del crecimiento bacteriano en el urocultivo, se presentó la modificación al
procedimiento de urocultivos y el procedimiento de recepción y rechazo de muestras.
Description
Urinary tract infections (UTIs) are globally considered the third most common cause
of infections after respiratory tract infections. Therefore, it is crucial to use diagnostic
tools such as the Urinalysis (UA) and urine culture, ensuring a correlation between
them to achieve an accurate and timely diagnosis for appropriate antimicrobial therapy,
thereby optimizing time and human resources in the laboratory and hospital. To
evaluate the compliance with the analytical phase in the diagnosis of UTIs in the
Microbiology Laboratory of the IESS General Hospital in Ibarra. A cross-sectional,
descriptive, observational, and prospective study with a mixed approach was
conducted, applying a checklist to assess compliance with the analytical phase. The
process and subsequent analysis of the chemical examination using the URIT-1600
equipment and the microscopic examination using the URIT-1280 equipment were
carried out. For the urine culture processing, calibrated loop inoculation (0.01 mL) was
performed, followed by identification and sensitivity testing using the PHOENIX M50
system.A total of 204 urine samples were analyzed, for which the checklist of internal
procedures established by the institution for both UA and urine culture analysis of each
sample was reviewed. The results indicated no statistically significant relationship
between the measured variables and the urine culture outcome. Regarding the isolation
of pathogens identified in the study, Escherichia coli was found to be the primary
causative agent of UTI, accounting for 57% of cases. Mixed flora (polymicrobial
contamination) was identified in 12% of samples, interpreted as sample contamination.
Klebsiella pneumoniae and Enterobacter cloacae, both significant hospital-associated
bacteria, were found in fourth and fifth places with a prevalence of 7%, and other
Enterobacterial pathogens accounted for 17%. A Pearson correlation test was
conducted to determine the correlation between UA and urine culture, demonstrating
a strong relationship between bacteria presence and urine culture results. In contrast, a
binomial logistic regression test revealed an 86.3% accuracy rate in predicting both
negative and positive urine culture results. There was a moderate correlation between
the presence of pyocytes and urine culture, with a predictive value of 77.5%, indicating
a good predictor of negative results but less precise for positive urine culture results.
It was observed that the predictive value for pyocytes could be improved when
associated with bacterial presence. Meanwhile, a null correlation was found between
xiii
squamous cells and urine culture results, indicating contamination during sample
collection. Based on these results, exclusion criteria for urine culture inoculation can
be considered, suggesting modifications and implementation of internal urine culture
procedures. The evaluation of the analytical phase determined that there is no
relationship between variables that did not meet the UA and urine culture analysis
procedure, indicating that they do not influence the final examination outcome for
either UA or urine culture. Different pathogenic agents were identified, with E. coli
being the most prevalent. The correlation between UA and urine culture was
established, demonstrating that bacteriuria and pyuria in UA aid in predicting bacterial
growth in urine culture. Modifications to the urine culture procedure and the sample
reception and rejection procedures were proposed.
Keywords
AGENTES PATÓGENOS BIOLÓGICOS, ESCHERICHIA COLI, INFECCIONES URINARIAS,, SISTEMA URINARIO